氟磺胺草醚在土壤中的残留期较长，用药量过大的话会对下茬作物造成药害。导致植株生长受抑制，出现叶片扭曲下垂、叶色失绿等症状，受害严重时整株枯死。
氟磺胺草醚使用方法
大豆苗后1-3片复叶时，杂草1-3叶期，每亩用25%水剂68-132毫升，对水20-30公斤，均匀喷雾杂草茎叶，杂草小、水分适宜用低药量，杂草大、水分条件差用高药量，氟磺胺草醚对大豆安全，但对玉米、高粱、蔬菜等作物敏感，施药时注意不要污染这些作物，以免产生药害。
氟磺胺草醚正常施用不会对下茬造成药害，但施药量过大，会对下茬敏感作物如白菜、小麦、高粱、玉米、甜菜、亚麻等产生药害。施药后，大豆叶片会有枯斑，但一周后会恢复正常，不影响后期生长。
但是在喷洒药的过程中往往会因为使用不当而造成药害，氟磺胺草醚药害发生后可喷施碧护0.136%赤·芸薹·吲乙可湿性粉剂、益微300亿/克蜡质芽孢杆菌可湿性粉剂、禾生素4%壳聚糖水剂等药促进植株恢复生长，根据受药害程度适量混配用药。
适用于大豆田防除龙葵、酸模叶蓼、节蓼、铁苋菜、反枝苋、凹头苋、刺苋、鸭跖草、水棘针、豚草、苘麻、藜、苍耳、曼陀罗、粟米草、马齿苋、裂叶牵牛、圆叶牵牛、香薷、卷茎蓼、苣荬菜、刺儿菜、问荆等阔叶杂草，也可用于果园等木本作物防除阔叶杂草，使用效果一般是非常显著的。
氟磺胺草醚药害可以根据药害程度适量混配碧护0.136%赤·芸薹·吲乙可湿性粉剂、益微300亿/克蜡质芽孢杆菌可湿性粉剂、禾生素4%壳聚糖水剂等药物，喷洒在发生药害的植物上，可以缓解药害造成的不良反应。
