国家苹果产业技术体系病虫害防控研究室曹克强等教授在对修剪工具传播腐烂病菌的试验中，发现带有病菌的锯子在修剪过程中可以传播腐烂病病菌并引起发病，且在不同时期修剪发病程度有显著差异。
在12月、1月、2月和3月的修剪试验中，12月和1月带菌修剪发病率超过了90%，而2月带菌修剪的发病率降低至50%，3月份带菌修剪的发病率只有2.5%。这表明修剪工具（尤其是锯子）在修剪过程中能够传播腐烂病菌。2012年我们对苹果树腐烂病的主要侵染时期进行了验证试验。结果验证了2010-2011年研究的结果，新伤口发病最重，而老伤口被侵染的几率低。从不同季节来看，冬季形成的伤口发病率最高，春季和夏季形成的新鲜伤口接种发病率为90%，而15日以上的老伤口均未发病。结合对我国不同苹果产区的调查，80%左右的腐烂病都发生在剪锯口处，因此认为，冬季修剪处理不当是造成近年来苹果树腐烂病严重发生的重要原因。从修剪时期来看，与12月、1月和2月相比，选择在3月份或者至少要在2月下旬开始进行集中修剪，结合修剪工具消毒以及伤口涂药保护等综合性预防措施更能有效地减少和控制该病菌的传播和侵染。
2012年在对腐烂病发生侵染规律研究中，发现了苹果腐烂病病斑的内部扩散现象。通过对苹果腐烂病病斑解剖，发现苹果腐烂病病斑在木质部的扩展程度明显大于韧皮部，并且大多数患病枝条在木质部有不同程度的黑色病变。从黑色病变区域中分离得到了45株真菌，经形态学研究和ITS序列比较分析，45株真菌中共鉴定出11个属。其中黑腐皮壳属真菌的分离比例最高，达到了44.4%，是苹果木质部黑色病变区域优势种群。
腐烂病病组织内部扩散现象的发现，解释了为何中后期的腐烂病难以防治，也解释了为何防控药剂难以评价，因此耕种帮建议对腐烂病病斑的刮治应该是越早、越小、越好。
