土壤“亚健康”主要表现在四个方面：①土壤酸化，土壤酸化一是影响作物的生长，到一定程度什么都不生长；二是影响肥效，施什么肥都没有效果；三是土壤有毒物质增加，使作物根系死亡；四是土壤团粒结构破坏严重，透气性降低。②土壤板结。土壤板结一是根系下扎困难，生长缓慢，产量降低；二是土壤含氧量降低，容易沤根；三是土壤盐渍化后，妨碍果树根系正常吸水，从而影响生长。③土壤茵群失调。土壤中的有益菌可改良根系生长的环境，而有害菌会引起土传病害。土壤菌群失调的原因主要是长期生产土壤有害茵数量增多，而有益菌不能得到很好的补充。④微量元素缺乏。果园连续种植，容易造成土壤养分偏耗，特别是硼、锌、铁等微量元素过多消耗，影响果树生长发育。
解决果园土壤“亚健康”问题，需要以土、肥、水为基础，对土壤进行包括有机物、有益微生物、微量元素等在内的全营养施肥。这样，既为土壤提供保健物质，也提高土壤系统的功能。让农家肥、有机肥重回果园最为基本。
有机微生物茵肥具有有机肥和生物茵剂双重功能，是1+1≥2的一类新型肥料，可修复土壤生态功能，保持土壤活力，促进土壤持续健康。同时，微生物菌肥的施用，还可显著改善土壤菌群结构，保护根系，提高土壤活力和各种肥料的利用率。
