土壤酶的新陈代谢过程实际上体现在土壤中的生物化学反应，推动着各种生化反应的，除微生物本身活动外，（实际上是酶促反应），则是各种相应的酶。因此人们甚至认为检测土壤酶活性比测微生物数量更能直接表达土壤总的生物活性。的确，很多研究证明，在不同土壤中某一群酶的活性与植物的生长有相关性，并且在具有不同的栽培历史的同一个土壤中也发现这种相关性，所以有些人认为土壤酶是一个有用的土壤肥力指标。不过到目前为止，要用某些酶作土壤指标仍存在一定的困难，不同作者不同材料往往得出不一致的结论，加有机质于土壤；对植物营养的静释放并不经常反应几类酶的潜在活性。周礼凯（1987）采用聚类分析的方法，分别将测得的、与土壤主要肥力因素有关的各种酶活性值和土壤理化特性参数进行了聚类，结果认为：用土壤中分布最广的酶活性的总体来表征土壤总体肥力水平是可行的。
