固氮酶的其它底物都是氮气还原的抑制剂,它们同N2竞争电子。氢是固氮作用的专一性竞争抑制剂,它不抑制其它底物的还原。另方面,H2也是固氮系统中的代谢产物,在特定条件下它能作为固氮作用的还原剂。固氮酶在还原N2的过程中,消耗于放H2的能量一般约占30%。有些固氮微生物细胞中有吸氢酶,它氧化H2,释放电子,这一作用是不可逆的。因而氢酶的存在使固氮酶消耗于放H2中的电子得以再利用,提高固氮效率。有些实验证明,用大豆根瘤菌吸氢酶副反应突变株接种的大豆有放H2作用,产量比亲本株接种的大豆低,固氮率小。
氢气的氧化不但提供了能量,而且由于消耗O2,对固氮酶起保护作用,还有可能避免H2对固氮酶还原N2的抑制作者。但是,生物细胞是复杂的体系,细胞内外环境与代谢作用有密切关系。因此吸氢酶对固氮作用的有利影响受其他因素的制约。例如,在限O2条件下圆褐固氮菌细胞中流向O2的电子比流向固氮酶的电子多得多,所以相对来说H2的再利用就不会有显著效益。在限O2或限N2的圆褐固氮菌培养中,H2:N2比例高,说明固氮酶产生的H2实际上很少被利用。在限C条件下则不同,H2:N2比例低,这时如果抑制吸氢酶活性,放H2作用显著增强,说明氢酶在未被抑制情况下利用氢气。利用吸氢酶来提高固氮效率还有待于进行深入的研究。