连作障碍已成为制约日光温室可持续发展的关键技术问题，其危害从当年的老菜区向新菜区逐年扩展，导致作物产量和品质明显下降。目前生产上采取的对策和措施概括起来可分为以下三类。
一、适应栽培法
1．增强抗性：选用抗病、耐盐的品种及实行幼苗嫁接换根栽培，都是生产上非常有效的方法。
2.实行轮作：将不同科属的作物按3～5年的间隔期，合理安排进行轮作。
3.化学处理：用诱抗剂阿波罗1000倍液与阿维菌素1000倍液混合，进行喷雾或灌根，可防治土传病害；用生物杀线剂33毫升/平方米喷雾，可防治土壤中的根结线虫。
4.无土栽培：将稻壳、草炭、烘干鸡粪按2：1：1的比例配成营养土，配合滴灌进行无害化栽培。有机质可使用2个生长季。
二、直接改良土壤法
1.换土法：即用大田优质肥沃土更换日光温室地表3～4厘米土层，可有效减轻连作障碍的危害。
2.高温消毒法：在6～8月于前茬作物拔秧后，每亩施石灰氮70～80公斤、粉碎麦秸500～1000公斤，旋耕、耙平。封严温室薄膜，盖严地膜后灌水，日晒高温处理15～20天后，温室通风并揭去地膜晾晒5～7天，再施肥、整地。如能在作物定植缓苗后每株用500～1000倍阿维菌素200毫升灌根，防治土传病虫害的效果更好。
3.揭膜淋溶休闲法：夏季揭去棚膜，进行休田或种植露地作物，让阳光充分曝晒温室土壤，让暴雨充分淋洗土壤中的盐分，可有效恢复地力。
4.灌溉洗盐法：换茬休闲时，在温室内灌满淡水，形成3～5厘米深的积水，待土壤盐分充分溶解后将水从排水沟排出，可有效降低土壤中的盐分。
三、间接改良土壤法
1.科学施肥法：在种植年限较长的温室，速效氮和速效磷含量已相当丰富，应增施生物肥、微肥、二氧化碳肥和有机肥等，大力推广秸秆还田。
2.轮作换茬法：连续种几年蔬菜后，栽培玉米、小麦等，可有效降低土壤盐分。
3.生物防治法：一是土壤中可引入拮抗菌抑制病原菌扩展；二是土壤中接种有益微生物分解有毒物质；三是利用一些作物（如葱、蒜）可释放一些化学物质来抑制病菌发展。
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