生物技术是20世纪90年代发展最快的一种技术，生物农药也必将成为21世纪农药创制工作中的重要组成。因为在环境中降解彻底，无残留，无污染，且具有非常高的生物活性，许多高毒和中毒生物农药成为无公害农药品种，甚至是用于防治蔬菜、茶树和果树病虫害的理想药剂。
但近年来的宣传、销售及部分文章给人一种印象，在医药、化妆品、农药及其它一些领域，凡是天然源的产品都是安全的，这种错误的观点不适于农药的安全生产与应用，不利于生物农药的发展。许多生物农药制剂并不能达到"高效、低毒、低残留和无污染"的全部要求。
生物农药并非都是低毒。许多天然源次生物或毒素是剧毒致病的物质，如蛇毒、毒蘑菇和河豚毒素等。有些正在研究或应用的生物农药也是高毒或中毒品种，在生产和应用中不注意安全，同样会引起人畜中毒。如氨基甲酸酯类农药是由毒扁豆中的毒扁豆碱衍生合成而来的，但毒扁豆碱却是一种对人畜高毒的物质，能使人瞳孔缩小，呼吸困难而死亡。
生物农药在生产过程中会产生有毒物质。如植物原材料在贮存过程中产生的黄曲霉毒素就是一个典型的例子。在热带和***带地区，由于加工贮藏条件不完善和存放时间过长，植物材料易受到黄曲霉和寄生曲霉的侵染而产生黄曲霉毒素。该毒素是潜在的对人类危害极为突出的一类强致癌诱变剂，是剧毒物质。被黄曲霉毒素污染的食物，对牛、羊、狗、小鸭、小鸡、兔、豚鼠和猫具有致癌作用。0.3％印楝素乳油的原材料是印楝种子，云南省、海南省、广东省和四川省南部地区是印楝适生区，印楝种子易受到黄曲霉和寄生曲霉的侵染。华南农业大学昆虫毒理研究室研制的印楝制剂，采用了除黄曲霉毒素的工艺，并申请了专利保护。但是，国内大多数生物农药研究者和生产企业没有重视黄曲霉毒素的污染问题。
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