1、抗休药期的规定使用。对有残留的抗生素要了解残留量和排泄期来分阶段使用。如青霉素要求在屠宰前两周停用；恩诺沙星类则要求在前7天停用，所以要掌握休药期，按屠宰时间选用抗生素。
2、按适应症选用抗生素。有的大肠杆菌对氨苄敏感，有的对恩诺沙星类敏感，还有的对新霉素敏感，最好根据药敏试验结果选用抗生素。
3、考虑反应和毒性选用抗生素。如青霉素作为毒性低、疗效好的抗生素在临床上广泛应用，但对个别家畜偶有过敏反应，这时就应选用无严重不良反应，毒性作用较低的红霉素等大环内酯类抗生素，再如土霉素和四环素的广谱抑菌药，成年反刍动物，马属动物和兔不宜内服，其他家畜也不宜长期使用，因对肝脏有损害。
4、交替使用抗生素。这在养鸡上特重要。肉仔鸡饲养两个月，只使用同一种抗生素会引起耐药性，要选用四五种以上，轮流使用，小鸡用预防量，大鸡用治疗量，疗程要短。
5、与消毒药交替使用。在饲养期内按期饮水消毒或喷雾消毒，减少使用抗生素。
6、用菌苗代替使用抗生素。如用大肠杆菌苗预防大肠杆菌病，用鼻炎弱毒苗预防传染性鼻炎，避免使用抗生素。
7、用中草药替代抗生素。按期拌料饲喂中草药，可达到不用抗生素制剂而不发病。
8、抗菌素不要与疫苗同时混用。接种时不能混用抗生素，至少不要在6小时内饮用抗生素，否则疫苗有可能被分解，抑制或杀死。
9、抗生素不要与活性菌一起用。活性菌的开发逐渐被应用到生产中，如益生素、多酶宝已用于养鸡业，同时使用会产生副作用或降低药效。
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