绿霉病。又叫绿僵霉菌病，是人工养殖蜈蚣的主要疾病。在6月中旬到8月底，由于气温高、湿度大，以及食物发生霉变，蜈蚣容易受到病菌的感染而得此病。受感染的蜈蚣早期主要是在关节的皮肤上出现黑色或绿色的小斑点，以后逐步扩大；继而体表失去光泽，腹部下面出现黑点，食欲减退，行动呆滞，最终因拒绝取食消瘦而死亡。发生该病的主要原因是饲养环境的湿度过大，或池内残存的食物腐烂霉变所致。
防治方法：⑴清除霉变的食物，喂新鲜的活食，保持好养殖池内的卫生，并进行消毒灭菌。⑵调节养殖池内的温湿度，保持通风散湿。⑶对发病的蜈蚣可用青霉素0.25克加水1公斤喷雾消毒或加水饮用。⑷可用食母生0.6克、土霉素0.25克共研成粗末，同400克饲料拌匀喂得病的蜈蚣，直到病愈。
腹胀病。蜈蚣多在秋后阴雨低温时期患此病，多因多食和低温所致。病蜈蚣早期头部呈紫红色，毒钩全张、不食或少食、腹部胀大、行动迟缓，发病1周左右后死亡。
防治方法：⑴用食母生1克加水500克拌匀，让其吸吮，并提高饲养温度。⑵用磺胺片0.5克研细后加300克饲料拌匀,隔日喂食，直至病愈。
脱壳病。由于蜈蚣栖息场所过于潮湿，使真菌在躯体寄生所引起。初期表现为不安躁动、来回爬动，后期表现为无力、行动滞缓，最终因不食不动而死亡。
防治方法：土霉素0.25克、食母生0.6克、钙片1克、共研成细末加400克饲料拌匀，连喂多日，直至病愈。
蚁害。正在蜕皮或产卵孵化期的蜈蚣抵抗能力弱，此时蚂蚁进入后会群起而攻之。致使蜕皮时的蜈蚣被咬死，或使孵化中的雌蜈蚣弃卵而逃。
防治方法：⑴在养殖池周围挖一圈围沟，注入水，可有效防止蚂蚁进入。⑵可用骨头、糖类、水果或其他甜食把蚂蚁诱引开后用开水烫死。
流产。孕蜈蚣流产多因受到干扰、翻动、嘈杂或异物的直接刺激所致，因此在孕期应保持安静，更不能经常翻动。此外，还要防止老鼠吞食成虫、幼体和卵而造成危害。
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